Amu Hinamori, une jeune fille cool, mais en fait plutôt réservée et peu sûre d'elle, rêve d'intégrer les Gardiens, un groupe de son école chargé de la protection des élèves. Pour cela, il faudrait un oeuf contenant un Shugo Chara, la personnalité rêvée de celui ou celle qui le possède.

Après la naissance d'un quatrième oeuf, Amu se retrouve seule et doute de ses compétences de joker.

Amu doit trouver un moyen de récupérer ses Charas dérobés par le professeur Nikaidô. Les Gardiens la soutiennent dans son combat.

Amu découvre que son rôle consiste à guetter les oeufs X et à les neutraliser afin que leur propriétaire puisse retrouver ses rêves.