Il y a fort longtemps, la guerre entre les forces de la Lumière et des Ténèbres faisait rage. Chaque belligérant possédait de grands pouvoirs mais le plus illustre était nommé le pouvoir de l’Ombre.

Les jeune Shu et Kluke se retrouvent coincés au milieu de la bataille. alors qu’il est sur le point de perdre tout ceux qu’il aime, Shu réveille le légendaire BLUE DRAGON, une Ombre.

Shu et ses amis apprennent que Logi détient l’extra 7 et décident de se rendre dans son vaisseau afin de le retrouver. Mais ce dernier tente de les arrêter en envoyant à leur rencontre Gilliam et ses sbires, Todd et Bishop.

Tandis que la recherche du troisième chapitre des Sept Suprêmes amène Shu et ses amis vers la terre natale de Marumaro, ce dernier est intimement convaincu que ce chapitre lui est destiné.

Logi et Shu finissent par s’affronter. Alors que Blue Dragon a le dessus sur Valkyrie et que l’issue du combat semble décidée, Logi invoque une nouvelle Ombre nommée Odin. Ce retournement de situation signifie clairement que Logi est lui aussi l’un des descendants des Sept Chevaliers de la Lumière.